effect of marker density and trait heritability on the accuracy of genomic prediction over three generations

نویسندگان

n. gorgani firozjah

h. atashi

m. dadpasand

m. j. zamiri

چکیده

the aim of this study was to determine the effect of marker density, level of heritability, number of qtls, and size of training set on the genomic accuracy over three generations. thereby, a trait was simulated with heritability of 0.10, 0.25 or 0.40. for each animal, a genome with 20 chromosomes, 1 morgan each, was simulated. different marker densities (2000, 4000 and 6000 markers) and 400 and 600 randomly distributed qtls were simulated. marker density, size of training set, and heritability level significantly affected the genomic accuracy (p< 0.05). increasing the marker density from 4000 to 6000 did not affect the genomic accuracy, likewise there was no difference between genomic accuracy of the first, and second validation sets (generations 8 and 9). the results showed that 4000 markers may be appropriate for genomic evaluation, and that the estimated marker effects can be used for at least two subsequent generations although the marker effects should be re-estimated for the third generation.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Effect of marker density and trait heritability on the accuracy of genomic prediction over three generations

The aim of this study was to determine the effect of marker density, level of heritability, number of QTLs, and size of training set on the genomic accuracy over three generations. Thereby, a trait was simulated with heritability of 0.10, 0.25 or 0.40. For each animal, a genome with 20 chromosomes, 1 Morgan each, was simulated. Different marker densities (2000, 4000 and 6000 markers) and 400 an...

متن کامل

Effects of Marker Density, Number of Quantitative Trait Loci and Heritability of Trait on Genomic Selection Accuracy

The success of genomic selection mainly depends on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and quantitative trait loci (QTL), number of QTL and heritability (h2) of the traits. The extent of LD depends on the genetic structure of the population and marker density. This study was conducted to determine the effects of marker density, level of heritability, number of QTL, and to ...

متن کامل

the effect of task complexity on lexical complexity and grammatical accuracy of efl learners’ argumentative writing

بر اساس فرضیه شناخت رابینسون (2001 و 2003 و 2005) و مدل ظرفیت توجه محدود اسکهان (1998)، این تحقیق تاثیر پیچیدگی تکلیف را بر پیچیدگی واژگان و صحت گرامری نوشتار مباحثه ای 60 نفر از دانشجویان زبان انگلیسی بررسی کرد. میزان پیچیدگی تکلیف از طریق فاکتورهای پراکندگی-منابع تعیین شد. همه ی شرکت کنندگان به صورت نیمه تصادفی به یکی از سه گروه: (1) گروه موضوع، (2) گروه موضوع + اندیشه و (3) گروه موضوع + اندی...

15 صفحه اول

the effect of traffic density on the accident externality from driving the case study of tehran

در این پژوهش به بررسی اثر افزایش ترافیک بر روی تعداد تصادفات پرداخته شده است. به این منظور 30 تقاطع در شهر تهران بطور تصادفی انتخاب گردید و تعداد تصادفات ماهیانه در این تقاطعات در طول سالهای 89-90 از سازمان کنترل ترافیک شهر تهران استخراج گردید و با استفاده از مدل داده های تابلویی و نرم افزار eviews مدل خطی و درجه دوم تخمین زده شد و در نهایت این نتیجه حاصل شد که تقاطعات پر ترافیک تر تعداد تصادفا...

15 صفحه اول

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
journal of livestock science and technologies

ناشر: shahid bahonar university of kerman and iranian society of animal science

ISSN

دوره 2

شماره 2 2014

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023